Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GSDMCQ9BYG8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms