Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSPO3Q9BXY4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms