Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RNF17Q9BXT8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RNF17Q9BXT8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms