Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SALL3Q9BXA9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SALL3Q9BXA9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms