Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC32Q9BV29 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms