Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RSG1Q9BU20 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RSG1Q9BU20 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms