Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PAGR1Q9BTK6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PAGR1Q9BTK6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms