Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
UPK3BQ9BT76 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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