Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MESP1Q9BRJ9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.1 ms