Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TUBA1CQ9BQE3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms