Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GABRG3Q99928 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GABRG3Q99928 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms