Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MEIS3Q99687 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MEIS3Q99687 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms