Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PKP4Q99569 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms