Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EYA3Q99504 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms