Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NUDCD1Q96RS6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NUDCD1Q96RS6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms