Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMTK3Q96Q04 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMTK3Q96Q04 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms