Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGAP1Q96PV0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGAP1Q96PV0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms