Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRERF1Q96PN7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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TRERF1Q96PN7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRERF1Q96PN7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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