Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
C9orf85Q96MD7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms