Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SENP8Q96LD8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SENP8Q96LD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms