Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDC3Q96F86 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms