Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
MALSU1Q96EH3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MALSU1Q96EH3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms