Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RUNDC1Q96C34 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RUNDC1Q96C34 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms