Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EME1Q96AY2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms