Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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TRIM63Q969Q1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TRIM63Q969Q1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TRIM63Q969Q1 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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