Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCE1Q969G3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms