Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RHBDD1Q8TEB9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms