Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SEMA6DQ8NFY4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SEMA6DQ8NFY4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms