Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC38A9Q8NBW4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms