Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAB2

KBTBD3, Kelch repeat and BTB domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KBTBD3Q8NAB2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
KBTBD3Q8NAB2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KBTBD3Q8NAB2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms