Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms