Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IGSF1Q8N6C5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IGSF1Q8N6C5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms