Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SVBPQ8N300 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SVBPQ8N300 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SVBPQ8N300 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SVBPQ8N300 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms