Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NLGN4XQ8N0W4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms