Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SKAP1Q86WV1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SKAP1Q86WV1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms