Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
STRCQ7RTU9 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
STRCQ7RTU9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms