Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CAPN12Q6ZSI9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CAPN12Q6ZSI9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms