Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
LRRC9Q6ZRR7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRRC9Q6ZRR7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms