Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TRIM72Q6ZMU5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms