Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KLHL35Q6PF15 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms