Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CTR9Q6PD62 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CTR9Q6PD62 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms