Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C9orf84Q5VXU9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms