Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 IGSF9-201ENST00000361509 3996 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
OBSCNQ5VST9 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms