Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
COL5A1-AS1Q5SY13 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms