Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAVIN4Q5BKX8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms