Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC93Q567U6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC93Q567U6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms