Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDCA8Q53HL2 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms