Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KLHL22Q53GT1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KLHL22Q53GT1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms