Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HSD17B12Q53GQ0 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HSD17B12Q53GQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms