Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLHL12Q53G59 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLHL12Q53G59 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms